La misión de la oficina de Auditoría Interna es la de fiscalizar mediante la verificación de la legalidad, eficiencia, efectividad y corrección de las transacciones fiscales, para la determinación y señalamientos de deficiencias, irregularidades, prácticas administrativas indebidas y la formulación de recomendaciones para corregirlas. A los efectos de cumplir con esa misión:
- Se fiscalizará las operaciones fiscales yadministrativas de la Comisión y se revisarán los controles internos.
- Se fiscalizará la fase administrativa de las Comisiones Locales y de las Juntas de Inscripción Permanente.
- La Oficina de Auditoría Interna participará en el diseño, desarrollo e implantación de los sistemas computarizados.